30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4698 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  100 
 
 		 119 aa  244  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  56.36 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  49.57 
 
 		 115 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  54.46 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  43.75 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  44.16 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  40.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  38.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  36.25 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  33.33 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  34.57 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  33.33 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  29.89 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  32.11 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1304  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  27.59 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  30.09 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  30.63 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  27.73 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  32.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  33.65 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  27.36 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>