32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3269 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3269  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.170183  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6102  hypothetical protein  58.14 
 
 		 259 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2033  tripartite tricarboxylate transporter TctA  64.63 
 
 		 166 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3358  hypothetical protein  62.84 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4010  protein of unknown function DUF1468  64.19 
 
 		 166 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0554  hypothetical protein  36.81 
 
 		 169 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2247  hypothetical protein  32.64 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1699  protein of unknown function DUF1468  32.17 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1626  protein of unknown function DUF1468  32.17 
 
 		 166 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.417426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5394  hypothetical protein  28.4 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3963  hypothetical protein  27.63 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511575  normal  0.0273458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3298  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.667523  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3223  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2746  protein of unknown function DUF1468  23.12 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1250  protein of unknown function DUF1468  22.5 
 
 		 162 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2564  protein of unknown function DUF1468  34.72 
 
 		 158 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0318  protein of unknown function DUF1468  26.71 
 
 		 162 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4403  hypothetical protein  32.23 
 
 		 154 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.209294  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3881  hypothetical protein  23.75 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3238  hypothetical protein  24.38 
 
 		 162 aa  49.3  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.020333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1331  hypothetical protein  32.11 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4103  hypothetical protein  29.77 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1720  hypothetical protein  22 
 
 		 152 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3167  protein of unknown function DUF1468  34.29 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1438  protein of unknown function DUF1468  28.95 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.832604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3289  hypothetical protein  26.95 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17193  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4019  hypothetical protein  24.86 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.242542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3458  protein of unknown function DUF1468  34.91 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0197428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7082  hypothetical protein  28.77 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3412  hypothetical protein  21.88 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>