More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3032 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  40.58 
 
 		 4268 aa  852    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  44.47 
 
 		 2006 aa  1259    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  44.05 
 
 		 2350 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 		 1157 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  41 
 
 		 2230 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 		 1825 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  37.61 
 
 		 1734 aa  845    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  42.71 
 
 		 3021 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  43.87 
 
 		 2706 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  36.43 
 
 		 1514 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  32.62 
 
 		 1888 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  32.23 
 
 		 1889 aa  730    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  40.89 
 
 		 1157 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  39.34 
 
 		 1845 aa  894    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  44.53 
 
 		 2258 aa  645    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  42.02 
 
 		 3002 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  33.27 
 
 		 1824 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  40.33 
 
 		 3194 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  100 
 
 		 1884 aa  3780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  41.15 
 
 		 4165 aa  866    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  33.73 
 
 		 1825 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  39.77 
 
 		 3739 aa  717    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  34.21 
 
 		 1809 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  33.46 
 
 		 1862 aa  812    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 		 1825 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  40.05 
 
 		 1835 aa  961    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  40.14 
 
 		 1837 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  34.4 
 
 		 1809 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.91 
 
 		 3252 aa  625  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  41.28 
 
 		 2619 aa  621  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  40.06 
 
 		 1104 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.04 
 
 		 1487 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  39.13 
 
 		 2200 aa  606  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  28.35 
 
 		 1497 aa  602  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  41.83 
 
 		 1131 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  31.51 
 
 		 3293 aa  595  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  43.4 
 
 		 2174 aa  591  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  31.46 
 
 		 3875 aa  589  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  39.89 
 
 		 2035 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  39.03 
 
 		 2023 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  38.94 
 
 		 2084 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  37.42 
 
 		 1897 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  35.89 
 
 		 2336 aa  572  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  40.3 
 
 		 1113 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  35.78 
 
 		 2338 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  38.71 
 
 		 2090 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  38.29 
 
 		 2057 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  35.78 
 
 		 2345 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  38.29 
 
 		 1894 aa  559  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  39.85 
 
 		 2310 aa  553  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  39.31 
 
 		 1317 aa  546  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  37.46 
 
 		 1158 aa  546  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  40.02 
 
 		 1174 aa  543  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  39.66 
 
 		 1678 aa  539  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  37.04 
 
 		 2896 aa  540  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  39.14 
 
 		 1321 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  39.27 
 
 		 1457 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  39.27 
 
 		 1457 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  37.51 
 
 		 1469 aa  515  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  33.24 
 
 		 1463 aa  516  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  40.04 
 
 		 1326 aa  512  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  39.43 
 
 		 1163 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  39.23 
 
 		 1438 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  40.15 
 
 		 1414 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  38.76 
 
 		 1457 aa  510  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  39.37 
 
 		 1167 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  39.37 
 
 		 1167 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  39.28 
 
 		 1167 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  38.94 
 
 		 1489 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  34.89 
 
 		 1193 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  33.82 
 
 		 1837 aa  498  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  38.94 
 
 		 1501 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.46 
 
 		 1436 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  38.5 
 
 		 1511 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 		 1152 aa  486  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  36.45 
 
 		 1149 aa  475  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  33 
 
 		 1042 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.95 
 
 		 1699 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  34.4 
 
 		 1084 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  33.68 
 
 		 2454 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  44.96 
 
 		 3275 aa  361  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1674  linear gramicidin synthetase subunit B  33.4 
 
 		 1567 aa  334  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995646  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  42.26 
 
 		 3173 aa  332  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0186  nonribosomal peptide synthetase  33.3 
 
 		 1567 aa  332  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1592  non-ribosomal peptide synthase  33.3 
 
 		 1567 aa  332  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  30.73 
 
 		 4136 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1214  peptide synthetase, putative  42.28 
 
 		 1574 aa  316  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.73 
 
 		 5149 aa  316  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  40.18 
 
 		 3163 aa  313  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  31.03 
 
 		 1405 aa  309  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.38 
 
 		 4478 aa  307  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09690  Non-ribosomal peptide synthetase, with condensation, AMP binding and thioesterase modules  29.19 
 
 		 1388 aa  306  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  30.84 
 
 		 1789 aa  304  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.92 
 
 		 3176 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.74 
 
 		 2581 aa  299  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  27.73 
 
 		 3235 aa  298  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.87 
 
 		 4747 aa  297  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  29.53 
 
 		 3470 aa  291  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  30.33 
 
 		 6176 aa  287  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  26.4 
 
 		 1556 aa  285  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>