284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2391 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  92.86 
 
 		 322 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  58.13 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  59.32 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  56.97 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  59.32 
 
 		 323 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  58.13 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  59.32 
 
 		 323 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  59.63 
 
 		 323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  54.77 
 
 		 323 aa  347  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  53.87 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4020  hypothetical protein  50.16 
 
 		 350 aa  318  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.023428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  54.27 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  48.93 
 
 		 329 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  38.51 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.19 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  40.68 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  38.32 
 
 		 453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.96 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  37.89 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.38 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  38.01 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  38.34 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  37.07 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  39.25 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.12 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  38.24 
 
 		 333 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  40.68 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  38.44 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.76 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  38.44 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  37.31 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  39.88 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  35.89 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  38.01 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  39.81 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  37.58 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  38.01 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  36.65 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  39.04 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  35.19 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  35.2 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  38.51 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  38.34 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  36.05 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  37.54 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  36.31 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  36.98 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  38.01 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  34.96 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  36.86 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  37.54 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  35.16 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  36.39 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  36.04 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1887  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  66.98 
 
 		 112 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  32.63 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  33.23 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  34.59 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.82 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.57 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  34.89 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  32.58 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  36.19 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  35.66 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  35.66 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  34.11 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.1 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  33.12 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  34.19 
 
 		 390 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  34.83 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  33.62 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  34.67 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  29.39 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  41.32 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 		 385 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.64 
 
 		 233 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  32.16 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.52 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.12 
 
 		 233 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  33.94 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  40 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.67 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  32.76 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  33.43 
 
 		 373 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.52 
 
 		 381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  30.81 
 
 		 397 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  38.92 
 
 		 230 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  32.84 
 
 		 373 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.46 
 
 		 234 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.67 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  38.92 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>