215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1838 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  100 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  89.39 
 
 		 333 aa  527  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  55.23 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  56.82 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  46.78 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.01 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.95 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.69 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.5 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.88 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.7 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.53 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.1 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  39.39 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  36.04 
 
 		 361 aa  196  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.76 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.94 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  42.09 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40.76 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.1 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.24 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  32.33 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.88 
 
 		 304 aa  189  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.48 
 
 		 348 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.67 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  40.45 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  40.45 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.17 
 
 		 348 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  32.33 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.88 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  41.12 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  39.41 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.99 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.71 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.85 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.22 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.57 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  31.67 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  31.67 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  31.67 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.53 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  37.66 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.67 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.55 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.97 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  33.22 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  36.76 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.39 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.44 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  34.22 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.44 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.9 
 
 		 322 aa  168  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.13 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1854  hypothetical protein  37.62 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  38.05 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.01 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  33.11 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  34.81 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.59 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.65 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  36.15 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.55 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  38.34 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.39 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.15 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  35.35 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.78 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.75 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  29.51 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.65 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.87 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.43 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.11 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  28.14 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.46 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.69 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.99 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.86 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  27.12 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06571  putative carboxypeptidase  36.05 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.35 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3416  carboxypeptidase  31.36 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17261  hypothetical protein  33.88 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1741  hypothetical protein  33.55 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0621  hypothetical protein  36.88 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05111  putative carboxypeptidase  28.06 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0583288  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.39 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  34.24 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.602476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.89 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1921  L,D-carboxypeptidase A  34.25 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04801  putative carboxypeptidase  27.87 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.957577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.18 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05181  putative carboxypeptidase  26.58 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.171155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05101  putative carboxypeptidase  29.14 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.252478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1882  L,D-carboxypeptidase A  34.8 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>