More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1551 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1551  cardiolipin synthetase  100 
 
 		 547 aa  1129    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970599  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  94.33 
 
 		 555 aa  1077    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0865  cardiolipin synthetase  58.26 
 
 		 589 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000163382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2240  cardiolipin synthetase  36.45 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1932  cardiolipin synthetase  38.29 
 
 		 532 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2009  normal  0.0149178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2320  cardiolipin synthetase  36.62 
 
 		 490 aa  336  7e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254629  hitchhiker  0.00334531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3316  cardiolipin synthetase  36.33 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  36.42 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  35.86 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  35.89 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1275  cardiolipin synthetase  34.92 
 
 		 484 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1390  cardiolipin synthetase  34.87 
 
 		 492 aa  316  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.853337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2290  cardiolipin synthetase  35.31 
 
 		 485 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189738  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2189  cardiolipin synthetase  34.27 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2689  cardiolipin synthetase  35.69 
 
 		 486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.087528  hitchhiker  0.00198607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1579  cardiolipin synthetase  36.85 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.643479  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0571  cardiolipin synthetase  34.4 
 
 		 491 aa  312  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01223  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.081482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2399  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0519529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1891  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0254745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2379  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173283  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01233  hypothetical protein  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1397  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.620611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1358  cardiolipin synthetase  34.47 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000070923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  34.77 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1735  cardiolipin synthetase  34.09 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0392497  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1930  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.608673  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1588  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1873  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.25903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1406  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.202549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1867  cardiolipin synthetase  34.19 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  34.96 
 
 		 486 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  35.31 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  35.31 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1418  cardiolipin synthetase  34.28 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.183618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1948  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 		 486 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2295  cardiolipin synthetase  33.82 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0305  cardiolipin synthetase  34.11 
 
 		 483 aa  289  1e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3886  cardiolipin synthetase 2  34.63 
 
 		 478 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2373  phospholipase D/transphosphatidylase  31.36 
 
 		 479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2049  cardiolipin synthetase 2  31.03 
 
 		 479 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0781048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1113  phospholipase D/transphosphatidylase  31.11 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3636  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.01 
 
 		 479 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0464  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.59 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2710  cardiolipin synthetase 2  31.25 
 
 		 489 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.583578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4302  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.36 
 
 		 491 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000415539  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1986  phospholipase D/transphosphatidylase  29.08 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3849  cardiolipin synthetase 2  30.62 
 
 		 491 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.45957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  28.65 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  28.85 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4114  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.71 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0831123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08050  cardiolipin synthetase 2  29.41 
 
 		 495 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3949  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.19 
 
 		 472 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03233  cardiolipin synthase  29.76 
 
 		 472 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  28.57 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.97 
 
 		 482 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  28.71 
 
 		 514 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  28.52 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  28.16 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.43 
 
 		 483 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.63 
 
 		 481 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  27.96 
 
 		 514 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  28.28 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.93 
 
 		 526 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  30.17 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  28.33 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  27.9 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  28.41 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  28.63 
 
 		 477 aa  178  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0242  phospholipase D/transphosphatidylase  29.94 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.733383  normal  0.348434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  29.69 
 
 		 484 aa  177  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  26.83 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  27.39 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  28.7 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0048  cardiolipin synthetase 2  27.31 
 
 		 487 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.12 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  25.14 
 
 		 483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0579  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.79 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.34 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0934  phospholipase D/transphosphatidylase  26.29 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  28.43 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  27.18 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  26.69 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  26.98 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  27.26 
 
 		 502 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.59 
 
 		 478 aa  170  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  26.5 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  26.5 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2455  phospholipase D/transphosphatidylase  26.49 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  27.69 
 
 		 485 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0354  cardiolipin synthetase  23.16 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00517773  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  27.41 
 
 		 483 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0345  cardiolipin synthetase  23.54 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0829  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.66 
 
 		 495 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00137347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>