37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1401 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1401  permease transmembrane protein  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337517  normal  0.139208 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1543  hypothetical protein  95 
 
 		 240 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107512  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1919  hypothetical protein  55.7 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2300  hypothetical protein  58.37 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548729  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0238  putative permease transmembrane protein  38.03 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  36.84 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3145  protein of unknown function DUF1275  37.73 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5806  hypothetical protein  31.47 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5590  hypothetical protein  31.84 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4851  hypothetical protein  36.84 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  32.28 
 
 		 196 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5590  hypothetical protein  33.64 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  30.24 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1490  hypothetical protein  32.94 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6339  hypothetical protein  32.94 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7005  hypothetical protein  33.76 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  30.86 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  29.89 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3824  hypothetical protein  34.3 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4133  protein of unknown function DUF1275  34.3 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5725  hypothetical protein  35.03 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0680  protein of unknown function DUF1275  31.52 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.265496 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1977  hypothetical protein  34.22 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0586  hypothetical protein  34.22 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.785468  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0679  hypothetical protein  34.22 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5464  protein of unknown function DUF1275  34.27 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3178  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  26.77 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0318  protein of unknown function DUF1275  27.01 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0313  protein of unknown function DUF1275  25.23 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000535924  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0750  hypothetical protein  24.1 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  25.45 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  24.75 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3258  hypothetical protein  24.57 
 
 		 243 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.213289  normal  0.46952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>