31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0234 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0263  putative type IV fimbrial biogenesis protein PilV  41.74 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  27.44 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  40.91 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  37.23 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  47.46 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  23.11 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  36.99 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  28.89 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  34.72 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  36.08 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35.59 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  42.37 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  31.15 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  38.71 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  37.29 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  31.88 
 
 		 171 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  32.84 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  32.73 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  40 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  36.11 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  33.71 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  33.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  34.92 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  31.58 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>