24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0263 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0263  putative type IV fimbrial biogenesis protein PilV  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  41.74 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  31.52 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  41.05 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  26.9 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  27.4 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  24.18 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  26.58 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  36.99 
 
 		 159 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  33.33 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  35.44 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  36.99 
 
 		 159 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  45.83 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  36.36 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  38.46 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  37.1 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  36.21 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  26.85 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  23.53 
 
 		 186 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  27.19 
 
 		 157 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  29.23 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  36.36 
 
 		 223 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>