More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5232 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  100 
 
 		 294 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  97.64 
 
 		 296 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  96.62 
 
 		 296 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  87 
 
 		 300 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  75.33 
 
 		 297 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  73.9 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  68.55 
 
 		 318 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  71.52 
 
 		 302 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  65.23 
 
 		 300 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  64.24 
 
 		 300 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  41.95 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  43.31 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  38.99 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  41.26 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 130 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 132 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  41.27 
 
 		 148 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  41.27 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 132 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  40.48 
 
 		 131 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.25 
 
 		 472 aa  92.8  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 188 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 129 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 129 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 126 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 126 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 131 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 126 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  37.82 
 
 		 126 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 129 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.77 
 
 		 133 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  37.6 
 
 		 128 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 132 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 131 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  36.8 
 
 		 124 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  42.62 
 
 		 129 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 128 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.35 
 
 		 134 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  31.76 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 127 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 127 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 135 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 126 aa  86.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 139 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 127 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 127 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  32.06 
 
 		 1374 aa  86.3  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 133 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  34.65 
 
 		 127 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.59 
 
 		 124 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.59 
 
 		 128 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 124 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 127 aa  85.9  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.77 
 
 		 229 aa  85.9  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 128 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 126 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 139 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 131 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 129 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  39.68 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  32 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>