241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4217 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  925    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  99.77 
 
 		 875 aa  1749    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 		 889 aa  942    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.82 
 
 		 881 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.35 
 
 		 878 aa  1399    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  94.29 
 
 		 875 aa  1620    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 875 aa  1752    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  82.92 
 
 		 878 aa  1407    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 912 aa  928    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.2 
 
 		 898 aa  912    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  74.94 
 
 		 878 aa  1238    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 		 879 aa  893    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  83.45 
 
 		 876 aa  1428    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 		 889 aa  942    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.2 
 
 		 878 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.94 
 
 		 879 aa  922    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.51 
 
 		 878 aa  910    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.45 
 
 		 873 aa  801    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  98.17 
 
 		 875 aa  1723    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.96 
 
 		 880 aa  909    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.54 
 
 		 887 aa  909    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.97 
 
 		 883 aa  909    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.68 
 
 		 876 aa  878    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.71 
 
 		 878 aa  901    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.91 
 
 		 872 aa  848    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.13 
 
 		 876 aa  941    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.89 
 
 		 879 aa  876    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  923    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.48 
 
 		 889 aa  942    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.48 
 
 		 889 aa  941    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.51 
 
 		 882 aa  845    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.17 
 
 		 882 aa  924    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  75.85 
 
 		 878 aa  1290    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.41 
 
 		 887 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.25 
 
 		 878 aa  891    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  55.18 
 
 		 883 aa  924    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.48 
 
 		 889 aa  943    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.38 
 
 		 888 aa  881    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  75.85 
 
 		 878 aa  1288    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.2 
 
 		 878 aa  912    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.48 
 
 		 887 aa  910    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.34 
 
 		 878 aa  889    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.72 
 
 		 877 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.96 
 
 		 881 aa  953    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.71 
 
 		 878 aa  922    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.26 
 
 		 889 aa  939    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.06 
 
 		 883 aa  927    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.62 
 
 		 883 aa  796    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.05 
 
 		 873 aa  863    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  925    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 		 889 aa  941    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.18 
 
 		 883 aa  929    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.05 
 
 		 879 aa  925    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.38 
 
 		 878 aa  906    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.04 
 
 		 883 aa  912    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  56.37 
 
 		 889 aa  941    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  80.3 
 
 		 878 aa  1360    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  42.77 
 
 		 1009 aa  630  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  40.34 
 
 		 1007 aa  615  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  42.06 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.88 
 
 		 929 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.18 
 
 		 914 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.87 
 
 		 952 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.38 
 
 		 931 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.52 
 
 		 929 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.67 
 
 		 938 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.66 
 
 		 936 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.82 
 
 		 933 aa  468  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.74 
 
 		 920 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.49 
 
 		 972 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.09 
 
 		 892 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 906 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.98 
 
 		 954 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.57 
 
 		 937 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.24 
 
 		 933 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.78 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.35 
 
 		 928 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.02 
 
 		 937 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 		 942 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.02 
 
 		 929 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.45 
 
 		 946 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.45 
 
 		 946 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.34 
 
 		 981 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.45 
 
 		 946 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.51 
 
 		 1006 aa  446  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 		 940 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.27 
 
 		 954 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.1 
 
 		 926 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.11 
 
 		 945 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.77 
 
 		 945 aa  442  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.99 
 
 		 989 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.66 
 
 		 937 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>