More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3491 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  97.6 
 
 		 125 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  95.16 
 
 		 125 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2009  endoribonuclease  78.23 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23720  putative translation initiation inhibitor  77.42 
 
 		 125 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0143605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  46.79 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  46.79 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  44.86 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  45.37 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  49.52 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44.86 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  44.86 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 166 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  45.87 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  48.62 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  93.2  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  43.93 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  48.62 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  50.46 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  46.79 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.04 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  49.07 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  39.82 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  41.59 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  42.98 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  41.12 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  44.86 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  43.81 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  49.52 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  44.86 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  43.12 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.64 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 130 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0090  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0741494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0552  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.897554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  41.44 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3111  Endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>