37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3370 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4050  hypothetical protein  36.89 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  49.02 
 
 		 1732 aa  69.7  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  50.62 
 
 		 1821 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  49.28 
 
 		 1048 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  45.78 
 
 		 1193 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  38.78 
 
 		 981 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  45.68 
 
 		 526 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  43.02 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  40.7 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  37.65 
 
 		 4630 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2086  hypothetical protein  44.64 
 
 		 60 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0114187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  38.37 
 
 		 2638 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  33.72 
 
 		 576 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  43.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1258  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.04 
 
 		 1418 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1591  hypothetical protein  22.83 
 
 		 310 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.851112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  38.14 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  48.53 
 
 		 554 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.75 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  38.67 
 
 		 688 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0826  sulfatase  37.84 
 
 		 627 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000772105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  34.57 
 
 		 1831 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.33 
 
 		 1965 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  47.06 
 
 		 570 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  41.38 
 
 		 556 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  41.03 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.29 
 
 		 1418 aa  46.2  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 1467 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 1937 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  43.01 
 
 		 1226 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4070  hypothetical protein  22.33 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  38.89 
 
 		 1171 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  32.35 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  36.96 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  55.1 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>