35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1598 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1598  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4270  hypothetical protein  98.13 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3835  extracellular solute-binding protein  84.52 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308177  normal  0.460192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1804  hypothetical protein  53.01 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.86185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1543  amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.84 
 
 		 245 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.807599  normal  0.747286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44640  hypothetical protein  51.79 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000281012  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  46.61 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  48.7 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  43.16 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  28.03 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01205  ABC-type amino acid transport/signal transduction system, periplasmic component/domain  24.19 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1862  hypothetical protein  26.03 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0011565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.44 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3602  hypothetical protein  33.08 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  25.94 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  23.77 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  24.36 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  22.08 
 
 		 490 aa  48.9  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0372  hypothetical protein  23.93 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  20.82 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  24.11 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  23.37 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  22.82 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2385  hypothetical protein  23.81 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  22.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  22.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  22.13 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  29.67 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 		 248 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  22.92 
 
 		 252 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>