More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0150 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0150  response regulator receiver protein  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5371  response regulator receiver protein  87.33 
 
 		 296 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  86 
 
 		 294 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5324  response regulator receiver protein  85.67 
 
 		 296 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0104194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  74.09 
 
 		 297 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  68.24 
 
 		 318 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  72.09 
 
 		 294 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  69.87 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  66.34 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  64.57 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  41 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4402  response regulator receiver protein  42.41 
 
 		 280 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1426  response regulator receiver protein  37.67 
 
 		 288 aa  215  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  39.3 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 130 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  40.94 
 
 		 132 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 126 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 126 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 126 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 126 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  39.68 
 
 		 148 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 126 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 129 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 129 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 129 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.59 
 
 		 472 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  42.06 
 
 		 129 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 127 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 122 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 129 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.89 
 
 		 131 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 		 131 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 127 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4151  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 132 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 131 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 135 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  32.82 
 
 		 1374 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 133 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 129 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  36.59 
 
 		 127 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 131 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  37.1 
 
 		 126 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.44 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  40.77 
 
 		 132 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  37.1 
 
 		 130 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  37.6 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 131 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 188 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.8 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  36.51 
 
 		 139 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  32.87 
 
 		 231 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 128 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  37.59 
 
 		 134 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  36 
 
 		 128 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 127 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 130 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 131 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 131 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 127 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  40.48 
 
 		 129 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 196 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2856  response regulator receiver protein  35.94 
 
 		 137 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  32.17 
 
 		 231 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  36.29 
 
 		 122 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  38.46 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  37.7 
 
 		 127 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 128 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 123 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 		 128 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 126 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 123 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>