20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4566 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  71.35 
 
 		 536 aa  778    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  63.29 
 
 		 526 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1058  parallel beta-helix repeat-containing protein  72.28 
 
 		 536 aa  772    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0674089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0884  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  95.57 
 
 		 519 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  81.13 
 
 		 523 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4566  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 		 519 aa  1067    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  68.35 
 
 		 543 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1026  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  64.73 
 
 		 511 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.931695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  98.27 
 
 		 557 aa  1060    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4442  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  97.88 
 
 		 519 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.094084  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  68.55 
 
 		 539 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.96 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1667  hypothetical protein  24.92 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.52 
 
 		 510 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 1121 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  21.71 
 
 		 1610 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  23 
 
 		 867 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  25.32 
 
 		 1839 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  21.71 
 
 		 1610 aa  43.9  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  24.68 
 
 		 1403 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>