More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3620 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3620  methyltransferase GidB  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4426  methyltransferase GidB  49.3 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  49.28 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  48.33 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3639  methyltransferase GidB  48.1 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3558  glucose inhibited division protein  46.41 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3463  glucose-inhibited division protein B  48.04 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3140  methyltransferase GidB  42.99 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2789  16S rRNA methyltransferase GidB  36.02 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.02 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5609  16S rRNA methyltransferase GidB  37.74 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5326  16S rRNA methyltransferase GidB  37.74 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5592  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000593206 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5633  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5335  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5163  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5732  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5669  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5179  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5275  16S rRNA methyltransferase GidB  37.26 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  38.43 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4022  16S rRNA methyltransferase GidB  36.79 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  40.67 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  38 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  36.32 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  36.56 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3555  16S rRNA methyltransferase GidB  36.74 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  33.96 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  38.1 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1192  methyltransferase GidB  35.71 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0331382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3786  16S rRNA methyltransferase GidB  40.54 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.393771  decreased coverage  0.000261644 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  34.9 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3484  methyltransferase GidB  29.63 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  40.33 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  36.84 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  30.45 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  30.89 
 
 		 239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  30.89 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  33.98 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.19 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  31.73 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  36.41 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  37.5 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1057  16S rRNA methyltransferase GidB  41.52 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.904694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  31.63 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  37.25 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2335  16S rRNA methyltransferase GidB  36.87 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  34.42 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0016  methyltransferase GidB  32.87 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525658  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1321  16S rRNA methyltransferase GidB  40.35 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  45.89 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  36.74 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0776  16S rRNA methyltransferase GidB  35.68 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.115198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  37.44 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0702  16S rRNA methyltransferase GidB  34.62 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1064  16S rRNA methyltransferase GidB  36.4 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.482961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0013  methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119734  hitchhiker  0.00444257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  35.24 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  32.09 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  39.04 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.91 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  34.69 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  33.91 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  34.74 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  33.76 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  37.88 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2943  methyltransferase GidB  37.75 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0074  16S rRNA methyltransferase GidB  33.63 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  34.18 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2394  16S rRNA methyltransferase GidB  34.43 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  32.89 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  32.73 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0050  16S rRNA methyltransferase GidB  35.93 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.368551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  32.91 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  39.2 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  39.2 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  36.73 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.34 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  33.49 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  35.06 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  37.63 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  40.45 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  33.65 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1629  16S rRNA methyltransferase GidB  34.33 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  34.56 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>