More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3419 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  84.3 
 
 
120 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  83.47 
 
 
120 aa  203  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  82.79 
 
 
122 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  80.17 
 
 
120 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  80.17 
 
 
120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  80.17 
 
 
120 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  61.34 
 
 
119 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1205  CheY response regulator  54.55 
 
 
123 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.310964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  55.46 
 
 
126 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  50.82 
 
 
124 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1672  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.494239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  44.54 
 
 
120 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  45.08 
 
 
139 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  45.83 
 
 
121 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  45.83 
 
 
129 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  45 
 
 
130 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  45 
 
 
130 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  45 
 
 
130 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  42.5 
 
 
121 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  43.33 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  43.59 
 
 
122 aa  97.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
129 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
125 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1411  FOG: CheY-like receiver  45.45 
 
 
131 aa  96.7  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.19514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.46 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  44.17 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  41.18 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  43.33 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4999  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  47.11 
 
 
127 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
298 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
125 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
125 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  47.32 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3542  response regulator receiver  40 
 
 
124 aa  94  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
385 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  42.15 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
385 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 
386 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  41.32 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
126 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1785  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0637089  normal  0.834554 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  42.98 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 
283 aa  90.5  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  43.9 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  47.01 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1998  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
120 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 
120 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  42.11 
 
 
121 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  40.5 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  44.17 
 
 
2301 aa  88.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  40.68 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  42.61 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  43.86 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 
122 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  43.33 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  40 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  43.36 
 
 
121 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 
131 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
122 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
120 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
122 aa  87  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  40 
 
 
126 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1535  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0267991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  40.94 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  42.74 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>