More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3090 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3090  response regulator receiver protein  100 
 
 
120 aa  239  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.820177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  57.98 
 
 
121 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  48.31 
 
 
121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  54.05 
 
 
121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  50.91 
 
 
122 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0637  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
121 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94997e-26 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
120 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
120 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
122 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  46.09 
 
 
1066 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  41.88 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  41.23 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
120 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  39.83 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  39.83 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  39.5 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
122 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
122 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
120 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
144 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
122 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
119 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
119 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
123 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
119 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  43.24 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
120 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  39.82 
 
 
119 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 
122 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  35.9 
 
 
121 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
117 aa  101  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
120 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  37.72 
 
 
120 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
120 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
123 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
120 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  39.32 
 
 
120 aa  98.2  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
120 aa  97.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  40 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1333  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
117 aa  97.4  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
119 aa  92.8  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
117 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
119 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0811  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0315  response regulator receiver domain-containing protein  37.72 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.48267  normal  0.327834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 
120 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
125 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  42.59 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3035  response regulator receiver domain-containing protein  39.29 
 
 
127 aa  87  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  37.72 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
118 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1380  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  34.21 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0157  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
123 aa  84  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3321  chemotaxis protein  40 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.628271  normal  0.0214541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  37.29 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  36.84 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  36.61 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0161  response regulator receiver domain-containing protein  34.21 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  33.91 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  33.96 
 
 
368 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
234 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1311  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  45.19 
 
 
364 aa  80.5  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.436181  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3003  two component Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 
465 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  35.65 
 
 
306 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  36.94 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  33.91 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  28.33 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.88 
 
 
266 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>