More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1335 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  68.1 
 
 		 932 aa  1368    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  75.75 
 
 		 930 aa  1495    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  76.64 
 
 		 927 aa  1465    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  40.15 
 
 		 916 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  40.67 
 
 		 938 aa  701    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  40.15 
 
 		 909 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 928 aa  1923    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 		 856 aa  250  9e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 		 817 aa  238  3e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 812 aa  237  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  25.32 
 
 		 700 aa  207  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 		 979 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.05 
 
 		 981 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 		 911 aa  187  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  24.43 
 
 		 909 aa  187  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 		 1065 aa  184  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.48 
 
 		 981 aa  184  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.97 
 
 		 969 aa  180  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 		 698 aa  178  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 805 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 		 978 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  25.47 
 
 		 978 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.93 
 
 		 978 aa  172  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.76 
 
 		 974 aa  172  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 973 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.93 
 
 		 978 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 973 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.11 
 
 		 973 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 973 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.31 
 
 		 820 aa  170  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.75 
 
 		 953 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.96 
 
 		 973 aa  168  5e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 		 974 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 978 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 1058 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 961 aa  167  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 974 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  23.96 
 
 		 1058 aa  162  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  24.23 
 
 		 789 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  34.98 
 
 		 764 aa  160  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.69 
 
 		 814 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.75 
 
 		 814 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.75 
 
 		 814 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 1062 aa  156  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.69 
 
 		 814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.15 
 
 		 839 aa  155  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.75 
 
 		 814 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.58 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.58 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.58 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.58 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.58 
 
 		 814 aa  154  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.52 
 
 		 814 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.52 
 
 		 814 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.09 
 
 		 958 aa  153  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 784 aa  153  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  33.44 
 
 		 807 aa  153  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  22.96 
 
 		 816 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.48 
 
 		 826 aa  152  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.47 
 
 		 814 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.96 
 
 		 816 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.73 
 
 		 898 aa  151  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.14 
 
 		 816 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.5 
 
 		 781 aa  151  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 		 760 aa  151  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  30.96 
 
 		 805 aa  150  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 934 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 		 876 aa  150  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  37.2 
 
 		 759 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.65 
 
 		 935 aa  149  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 837 aa  147  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  31.9 
 
 		 732 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  35.74 
 
 		 739 aa  147  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.1 
 
 		 968 aa  146  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.17 
 
 		 760 aa  146  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  28.46 
 
 		 760 aa  146  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 760 aa  145  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  26.25 
 
 		 932 aa  145  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.27 
 
 		 814 aa  145  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 		 739 aa  144  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 		 817 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.73 
 
 		 917 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 764 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.99 
 
 		 760 aa  142  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.07 
 
 		 764 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.78 
 
 		 973 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  31.8 
 
 		 730 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.21 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  36.08 
 
 		 739 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.56 
 
 		 836 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.56 
 
 		 923 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  33.45 
 
 		 1073 aa  140  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  32.97 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.51 
 
 		 928 aa  139  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1456  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.83 
 
 		 808 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  35.69 
 
 		 737 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 		 738 aa  138  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 		 731 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>