41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1277 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  76.34 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1153  hypothetical protein  61.65 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.948383  normal  0.0186046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  53.44 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  41.13 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  41.13 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  41.13 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  33.85 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  36.29 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  38.71 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  35.2 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  30.47 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  30.51 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3010  PilT protein-like  35.71 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  28.8 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  31.2 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  34.92 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  27.97 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  36.44 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  27.2 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  27.12 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  33.09 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  32.48 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1522  PilT protein domain protein  30 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3102  PilT protein domain protein  30.51 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0561  PilT protein domain protein  30.51 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.183955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  28.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3234  PilT protein domain protein  28.23 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  36.04 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  34.43 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  23.73 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1056  PilT protein domain protein  26.5 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  28.06 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1941  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0375  PilT domain-containing protein  26.5 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  25.98 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1214  hypothetical protein  29.51 
 
 		 125 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000226808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>