More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4711 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
338 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.34 
 
 
338 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  97.34 
 
 
338 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  73.08 
 
 
338 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  67.46 
 
 
341 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  67.46 
 
 
341 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  67.16 
 
 
341 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  67.16 
 
 
338 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.29 
 
 
341 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  63.39 
 
 
341 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  57.74 
 
 
340 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.51 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.51 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.15 
 
 
344 aa  331  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.56 
 
 
347 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50 
 
 
499 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  49.26 
 
 
365 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  49.26 
 
 
365 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.7 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.66 
 
 
356 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  49.26 
 
 
355 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  48.66 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.37 
 
 
356 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0375  putative transposase  49.54 
 
 
345 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  47.37 
 
 
338 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 
343 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.45 
 
 
343 aa  298  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
338 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
338 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
338 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
338 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  47.51 
 
 
338 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  47.98 
 
 
343 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
338 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  44.87 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.57 
 
 
338 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.66 
 
 
355 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.66 
 
 
355 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.66 
 
 
355 aa  289  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.87 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
338 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
338 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.03 
 
 
338 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  46.13 
 
 
322 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.36 
 
 
338 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.57 
 
 
338 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.39 
 
 
332 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.39 
 
 
332 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.39 
 
 
332 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.39 
 
 
332 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  44.25 
 
 
341 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3216  transposase IS116/IS110/IS902  43.37 
 
 
385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118777  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  44.61 
 
 
341 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.31 
 
 
342 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.45 
 
 
346 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2242  transposase family protein  42.23 
 
 
455 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860997  normal  0.210427 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7630  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.71 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  42.86 
 
 
338 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.49 
 
 
340 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.76 
 
 
341 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  47 
 
 
298 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.95 
 
 
338 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.47 
 
 
341 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  43.67 
 
 
337 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  43.67 
 
 
337 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.41 
 
 
302 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.13 
 
 
318 aa  256  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  41.47 
 
 
343 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.6 
 
 
340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.593308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  41.32 
 
 
338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  41.32 
 
 
338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  41.32 
 
 
338 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  41.32 
 
 
338 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2122  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
337 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0571042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2204  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
337 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  43.07 
 
 
343 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  43.07 
 
 
343 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  43.07 
 
 
343 aa  248  9e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.07 
 
 
340 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  48.25 
 
 
285 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  40 
 
 
343 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  43.07 
 
 
343 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>