84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4423 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4423  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 407 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.395598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3790  filamentation induced by cAMP protein Fic  59.11 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0896  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.49 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2840  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.02 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0093  filamentation induced by cAMP protein Fic  39.55 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0014  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.98 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4624  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.79 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4212  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.05 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.515355  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4061  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.25 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0861  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.96 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0426  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.23 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.444251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2460  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.56 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0851  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.21 
 
 		 404 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2534  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.31 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1372  fic family protein  39.22 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0025  putative cAMP-induced filamentation protein  37.94 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.337972 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1908  hypothetical protein  34.65 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3358  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.62 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.855479  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.41 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36540  Fic (filamentation induced by cAMP) protein  36.94 
 
 		 374 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4217  hypothetical protein  35.12 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.921636  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4020  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.92 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0445  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.82 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1842  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.62 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4032  hypothetical protein  37.38 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2568  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.94 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0711  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.17 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0460  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.29 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0676  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.24 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.721165  normal  0.0136984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3428  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.469085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0777828  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0951  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0896  Fic family protein  33.33 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0753  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.424532  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.93 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0317  hypothetical protein  47.46 
 
 		 172 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0608446  normal  0.0902028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3516  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.88 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.438285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.56 
 
 		 358 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4508  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.69 
 
 		 317 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.21 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.74 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.9 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0625  filamentation induced by cAMP protein Fic  21.83 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.849792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0217  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.51 
 
 		 508 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.2 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4358  Fic protein family  26.62 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.069593  hitchhiker  0.000000000897295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.39 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1541  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.46 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  25.11 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4266  hypothetical protein  25.36 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0810  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.21 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1731  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.41 
 
 		 380 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.59 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0799  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.57 
 
 		 267 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0037  filamentation induced by cAMP protein Fic  20.49 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  27.5 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  25.65 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2527  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.9 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.48 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2616  death-on-curing family protein  36.62 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  25.84 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28800  hypothetical protein  32.8 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287413  decreased coverage  0.000000000406133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0293  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.92 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.29 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  28.68 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2564  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.42 
 
 		 243 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.48 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0452  fic family protein  36.62 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1471  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.66 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.14 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.55 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 309 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.04 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  22.48 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0970  fic family protein  24.44 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.51 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  24.4 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  24.4 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.18 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  22.61 
 
 		 375 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2119  hypothetical protein  24.31 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.25 
 
 		 514 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1723  MloA protein, putative  19.4 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.325605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  32.79 
 
 		 373 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>