36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4370 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  56.87 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  55.31 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  55.31 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  54.34 
 
 		 330 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  50.66 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  51.03 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  47.23 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  46.2 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  47.46 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  38.54 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  39.93 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  40.21 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  40.07 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  37.63 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  40.48 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  36.57 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  35.95 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  39.38 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  36.63 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  50.61 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  34.95 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  37.59 
 
 		 146 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  33.55 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  26.79 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  25.08 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  62.22 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  26.42 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  29.69 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  27.96 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  51.22 
 
 		 84 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  27.6 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  30.63 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  26.35 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  23.89 
 
 		 399 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>