31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4287 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  61.9 
 
 
640 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  61.9 
 
 
641 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  60 
 
 
598 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  62.5 
 
 
778 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  54.1 
 
 
635 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  56.14 
 
 
615 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  50 
 
 
617 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  50.91 
 
 
588 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  47.37 
 
 
592 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  49.12 
 
 
593 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  40.38 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  40.38 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  36 
 
 
548 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  42.5 
 
 
760 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  38.1 
 
 
522 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  40.48 
 
 
754 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  40.48 
 
 
754 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  50 
 
 
584 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  39.22 
 
 
575 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  38.1 
 
 
657 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  38.46 
 
 
570 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  39.22 
 
 
575 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  35.71 
 
 
705 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  41.46 
 
 
546 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  43.9 
 
 
576 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  35.71 
 
 
555 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  43.9 
 
 
764 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  42.55 
 
 
582 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  45 
 
 
756 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>