More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3187 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
333 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  28.79 
 
 
290 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  28.41 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
321 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
924 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  23.49 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.83 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  26.07 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
316 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
271 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
460 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  32.98 
 
 
785 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  39 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
398 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  32.69 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
272 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
626 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
373 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
414 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
362 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  30.63 
 
 
344 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  34.65 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
374 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  33.67 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
672 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.7 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  30.39 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  30.39 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  29.73 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  28.43 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  35.19 
 
 
848 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  29.73 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  29.73 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0145  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
420 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  31.03 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  22.99 
 
 
454 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.5 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0640  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  33.65 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.08 
 
 
314 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  27.8 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
348 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  25.1 
 
 
292 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
324 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.43 
 
 
317 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
291 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  31.91 
 
 
344 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
290 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
253 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35 
 
 
326 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
355 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.95 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  30.85 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>