41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2361 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  100 
 
 
160 aa  309  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  56.25 
 
 
154 aa  157  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  72.13 
 
 
155 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  52.24 
 
 
156 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  51.67 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  42.18 
 
 
151 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  47.93 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  47.89 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  47.89 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  40.85 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  40.85 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  49.61 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  45.6 
 
 
154 aa  90.9  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  40.65 
 
 
145 aa  87.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  40.31 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  35.86 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  36.57 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  41.55 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  37.9 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  34.04 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  38.81 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  36.8 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  30.86 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  35.43 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  37.4 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  36.69 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  39.36 
 
 
189 aa  51.2  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  33.85 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  41.94 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  36.67 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  38.1 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.89 
 
 
752 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.89 
 
 
730 aa  47.8  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  39.57 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  31.62 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  31.39 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0428  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.77 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  35.53 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  32.14 
 
 
738 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>