More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0797 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  82.81 
 
 		 416 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  86.54 
 
 		 416 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 416 aa  834    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  66.59 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  60.49 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  58.41 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  56.69 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  58.45 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  60.35 
 
 		 396 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  56.19 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  55.2 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 		 392 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  41.79 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 		 398 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  42.01 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  42.37 
 
 		 397 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  42.13 
 
 		 409 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  40.89 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  40.54 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  39.7 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  42.13 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  42.13 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  40.25 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.9 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  40.35 
 
 		 391 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  39.8 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  41.34 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  40.15 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  41.65 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  41.65 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  40.35 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  41.65 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  40.1 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  39.85 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  39.51 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  39.4 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  39.36 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  39.21 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  40.64 
 
 		 394 aa  259  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  39.6 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  39.7 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  39.21 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  39.21 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  39.21 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  39.36 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  38.96 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  38.96 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  38.96 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  38.71 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  38.96 
 
 		 427 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  39.51 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  38.71 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  39.9 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  41.32 
 
 		 402 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  38.46 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  39.11 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.69 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  38.15 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  39.51 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  41.56 
 
 		 401 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  39.31 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  40.75 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  39.8 
 
 		 393 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  40.35 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  37.93 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  37.44 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  39.56 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  39.75 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  39.56 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  38.53 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  38.98 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  39.04 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  38.82 
 
 		 393 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  38.82 
 
 		 393 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  37.13 
 
 		 392 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.78 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4142  acetyl-CoA acetyltransferases  40.1 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.736685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  38.48 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  39.66 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  38.27 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  39.51 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  39.71 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  38.63 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  38.21 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  38.18 
 
 		 393 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>