More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1721 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  62.17 
 
 
233 aa  310  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  63.04 
 
 
234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  56.83 
 
 
231 aa  268  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  56.83 
 
 
231 aa  267  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  47.84 
 
 
238 aa  217  1e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  44.54 
 
 
234 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  42.79 
 
 
234 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  43.23 
 
 
234 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  45.02 
 
 
274 aa  206  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  43.1 
 
 
236 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  42.37 
 
 
245 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  43.23 
 
 
234 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  42.13 
 
 
237 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  45.65 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  42.55 
 
 
246 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  42.62 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  44.87 
 
 
236 aa  196  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  41.28 
 
 
237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  41.28 
 
 
237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  42.67 
 
 
239 aa  195  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  39.83 
 
 
242 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  42.67 
 
 
241 aa  195  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  43.1 
 
 
238 aa  194  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  42.98 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  43.53 
 
 
238 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  42.42 
 
 
240 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  44.83 
 
 
247 aa  193  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0502  uridylate kinase  45.78 
 
 
238 aa  193  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  42.42 
 
 
237 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  42.86 
 
 
235 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  42.42 
 
 
240 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  43.29 
 
 
239 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  41.63 
 
 
237 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  43.29 
 
 
236 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  43.53 
 
 
235 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  41.56 
 
 
241 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  41.99 
 
 
240 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  43.97 
 
 
238 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  40.26 
 
 
238 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  43.83 
 
 
235 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  41.2 
 
 
239 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  42.42 
 
 
251 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  44.16 
 
 
239 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  42.42 
 
 
251 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  42.42 
 
 
251 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  40.85 
 
 
242 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  40.26 
 
 
253 aa  189  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  39.39 
 
 
242 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  43.04 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  43.29 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  40.77 
 
 
240 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  44.16 
 
 
239 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  43.4 
 
 
243 aa  188  5e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  38.79 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  38.79 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0481  uridylate kinase  44.59 
 
 
245 aa  188  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  43.1 
 
 
235 aa  188  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  43.1 
 
 
235 aa  188  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  37.97 
 
 
242 aa  187  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  39.83 
 
 
237 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  40.69 
 
 
236 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  40.26 
 
 
237 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  41.99 
 
 
236 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  38.53 
 
 
240 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  38.53 
 
 
240 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  39.83 
 
 
235 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  41.13 
 
 
237 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  41.77 
 
 
245 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  42.98 
 
 
243 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  41.2 
 
 
236 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  41.56 
 
 
239 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  41.92 
 
 
237 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  41.13 
 
 
236 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  41.48 
 
 
237 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  41.38 
 
 
241 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  40.69 
 
 
247 aa  185  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  39.66 
 
 
244 aa  185  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  41.56 
 
 
249 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  40.69 
 
 
240 aa  184  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  40.87 
 
 
241 aa  184  8e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  40.26 
 
 
240 aa  184  9e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  42.22 
 
 
244 aa  184  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  38.1 
 
 
246 aa  184  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  40 
 
 
241 aa  184  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  40.26 
 
 
238 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  38.89 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  40.69 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  40.26 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  39.83 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  40.34 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  36.86 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  39.91 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  41.92 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  41.56 
 
 
239 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  38.7 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  40.26 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  40.26 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  40.26 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  40.26 
 
 
239 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>