More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1012 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0125  CTP synthetase  68.29 
 
 
524 aa  748    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107739  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0784  CTP synthetase  66.54 
 
 
525 aa  734    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0197  CTP synthetase  66.1 
 
 
525 aa  732    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000237577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0123  CTP synthetase  68.29 
 
 
524 aa  748    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000806714  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1012  CTP synthetase  100 
 
 
527 aa  1066    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  50.65 
 
 
542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  50.47 
 
 
533 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  48.88 
 
 
533 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  51.61 
 
 
534 aa  509  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  49.72 
 
 
541 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  49.26 
 
 
536 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  47.73 
 
 
530 aa  504  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  47.37 
 
 
537 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  48.24 
 
 
559 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  49.72 
 
 
534 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  48.15 
 
 
535 aa  502  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.357981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  50.19 
 
 
535 aa  501  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  47.96 
 
 
563 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  50.83 
 
 
531 aa  501  1e-140  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  48.11 
 
 
535 aa  495  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  48.58 
 
 
545 aa  495  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  47.42 
 
 
540 aa  498  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  47.24 
 
 
542 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  46.45 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  48.3 
 
 
531 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  46.89 
 
 
533 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  46.49 
 
 
543 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  46.45 
 
 
542 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  47.29 
 
 
534 aa  495  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  47.29 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  46.27 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  47.93 
 
 
542 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  46.45 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  45.84 
 
 
543 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  48.22 
 
 
535 aa  491  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  48.69 
 
 
533 aa  488  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  45.66 
 
 
543 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  45.97 
 
 
539 aa  490  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  47.36 
 
 
554 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.29 
 
 
537 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  46.35 
 
 
543 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  46.46 
 
 
542 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  46.94 
 
 
552 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  46.28 
 
 
535 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  46.28 
 
 
535 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  46.85 
 
 
557 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  46.89 
 
 
555 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  46.63 
 
 
550 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  47.22 
 
 
555 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  47.23 
 
 
534 aa  487  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  49.08 
 
 
533 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  49.26 
 
 
533 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3181  CTP synthetase  45.95 
 
 
563 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  47.28 
 
 
536 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  47.68 
 
 
548 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  45.95 
 
 
559 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  45.69 
 
 
542 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  46.91 
 
 
552 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  45.69 
 
 
542 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  48.37 
 
 
546 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  45.52 
 
 
566 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  47.28 
 
 
536 aa  486  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  47.09 
 
 
559 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  45.69 
 
 
538 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0427  CTP synthetase  45.64 
 
 
552 aa  483  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.441516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  46.8 
 
 
552 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  45.87 
 
 
543 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  48.51 
 
 
536 aa  484  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  46.49 
 
 
538 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  46.6 
 
 
531 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  45.09 
 
 
554 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  48.06 
 
 
545 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  45.76 
 
 
543 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  45.97 
 
 
538 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  45.76 
 
 
543 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  46.07 
 
 
535 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2648  CTP synthetase  46.18 
 
 
555 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  48.7 
 
 
534 aa  480  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  48.43 
 
 
541 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  49.07 
 
 
533 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2717  CTP synthase  48.98 
 
 
568 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  48.34 
 
 
530 aa  480  1e-134  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  46.3 
 
 
555 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  47.1 
 
 
542 aa  478  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  46.5 
 
 
546 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  47.23 
 
 
543 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  46.37 
 
 
535 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  46.37 
 
 
535 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  46.37 
 
 
535 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  47.03 
 
 
547 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  45.98 
 
 
535 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  46.04 
 
 
554 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  45.59 
 
 
549 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  46.37 
 
 
535 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  46.37 
 
 
535 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  47.23 
 
 
543 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  47.04 
 
 
539 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  44.86 
 
 
547 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  44.86 
 
 
547 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2594  CTP synthetase  46.27 
 
 
551 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.693911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>