More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3550 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3550  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.494176  normal  0.0996929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11440  hypothetical protein  67.53 
 
 		 274 aa  346  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  42.17 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  40.38 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  40.51 
 
 		 328 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  40.51 
 
 		 334 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  41.74 
 
 		 266 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  40.08 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  40.71 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  40.64 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  39.29 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  41.43 
 
 		 279 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  40.95 
 
 		 317 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  40.25 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  40.25 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  40.09 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  39.58 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  38.56 
 
 		 447 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  39.17 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  38.72 
 
 		 282 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  39.66 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  37.26 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  40.8 
 
 		 279 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  39.17 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.17 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  39.83 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  39.83 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  36.21 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  40.53 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  39.68 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  39.06 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  40.08 
 
 		 370 aa  171  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.65 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  39.5 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  39.3 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  38.79 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  37.66 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.98 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  32.17 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  39.47 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  36.1 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  40.17 
 
 		 303 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  35.18 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.33 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  37.5 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  39.47 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  39.47 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.52 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  38.1 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  37.79 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  37.79 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  39.5 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  37.79 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  33.21 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  37.89 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  38.1 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.04 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  34.14 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  36 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  38 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  37.89 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  34.38 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  34.29 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.82 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  37.44 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  36.87 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  35.06 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  34.78 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  38.4 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  35.42 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  38.08 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  34.17 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  36.43 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  38.22 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  37.66 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3660  hypothetical protein  37.31 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.805897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  34.39 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  35.48 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  35.8 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  32.51 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  35.96 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  33.87 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  34.75 
 
 		 284 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.33 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  33.75 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  36.13 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  29.66 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  34.51 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  34.38 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  34.51 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  34.82 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  35.02 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  34.07 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>