33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2336 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  49.73 
 
 		 387 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  50.87 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  50 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  59.73 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  46.98 
 
 		 153 aa  106  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3469  hypothetical protein  46.46 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3114  hypothetical protein  46.46 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212423  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  40.31 
 
 		 126 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  36.03 
 
 		 1461 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  36.59 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  36.03 
 
 		 214 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  36.08 
 
 		 222 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  37.69 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  38.69 
 
 		 839 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  43.14 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  36.22 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  29.2 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  32.35 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  29.36 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1227 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  39.08 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4350  hypothetical protein  32.71 
 
 		 131 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00663093  normal  0.0999506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1586 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  30.83 
 
 		 556 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>