147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2225 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 66 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  62.9 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  62.9 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  46.55 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  45.16 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  39.34 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  44.62 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  44.62 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  43.08 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  36.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0225  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  39.68 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.16 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  36.07 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  33.87 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 783 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  43.55 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0117  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  37.7 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 836 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 836 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  31.25 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 		 56 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0802  copper-transporting P-type ATPase  32.26 
 
 		 902 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 65 aa  43.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 66 aa  43.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  34.43 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 762 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 762 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 762 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>