More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3922 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3922  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  100 
 
 
596 aa  1208    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5720  putative heat-shock chaperone protein  48.94 
 
 
621 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.531884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1752  putative heat-shock chaperone protein  49.27 
 
 
614 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2124  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  48.61 
 
 
622 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1320  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  48.77 
 
 
615 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0151  molecular chaperone  48.65 
 
 
622 aa  535  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1457  putative chaperone protein  48.45 
 
 
615 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1826  putative heat-shock chaperone protein  46.72 
 
 
606 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0143123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0045  heat shock protein 70  48.45 
 
 
615 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5108  molecular chaperone-like protein  48.86 
 
 
613 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.968057  normal  0.0457936 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1545  putative chaperone protein  48.45 
 
 
615 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3677  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  48.05 
 
 
637 aa  528  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786071  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1305  DnaK-related protein  46.96 
 
 
658 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5540  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  47.09 
 
 
619 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218183  normal  0.0196967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0058  DnaK-related protein  47.71 
 
 
615 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3739  putative DnaK-related protein (molecular chaperone)  46.17 
 
 
610 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676013  normal  0.253359 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003558  DnaK-related protein  45.3 
 
 
651 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00228279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02519  molecular chaperone  44.92 
 
 
654 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3574  molecular chaperone-like protein  48.21 
 
 
613 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0682429  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3946  molecular chaperone-like protein  47.88 
 
 
613 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537274  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0497  putative heat-shock chaperone protein  47.03 
 
 
636 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3131  putative heat-shock chaperone protein  47.97 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3696  putative heat-shock chaperone protein  47.03 
 
 
636 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297588  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2545  molecular chaperone-like  47.88 
 
 
613 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173516  normal  0.908818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3232  putative heat-shock chaperone protein  47.97 
 
 
627 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.838749  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5308  molecular chaperone-like protein  47.96 
 
 
613 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3489  molecular chaperone-like protein  47.8 
 
 
613 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00629635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2134  putative molecular chaperone protein HspA/DnaK  48.29 
 
 
619 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.660367  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3033  putative heat-shock chaperone protein  46.63 
 
 
631 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1232  chaperone DnaK-related protein  42.48 
 
 
643 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3013  putative heat-shock chaperone protein  45.93 
 
 
620 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2054  heat shock protein 70  42.69 
 
 
592 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0987  hypothetical protein  46.86 
 
 
513 aa  445  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3231  DnaK-related protein  45.71 
 
 
929 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.717764  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3130  DnaK-related protein  45.54 
 
 
929 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3032  DnaK-related protein  45.77 
 
 
925 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192124  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3575  molecular chaperone-like protein  42.35 
 
 
918 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0471148  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0343  DnaK-related protein  41.44 
 
 
971 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.87364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5107  molecular chaperone-like protein  42.9 
 
 
918 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3945  molecular chaperone-like protein  41.86 
 
 
918 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.922254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0152  Heat shock protein 70  43.39 
 
 
987 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3490  molecular chaperone-like protein  42.81 
 
 
918 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0310238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2544  molecular chaperone-like  42.13 
 
 
914 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.374028  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5309  molecular chaperone-like protein  42.05 
 
 
918 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3012  DnaK-related protein  44.43 
 
 
936 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.791103  normal  0.506034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3676  putative chaperone protein, HscA/DnaK  41.35 
 
 
966 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.771726  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1753  putative chaperone heat-shock protein  41.76 
 
 
926 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1319  DnaK-related protein  42.03 
 
 
931 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.981392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1458  DnaK-related protein  41.6 
 
 
935 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.103212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5541  DnaK-related protein  40.73 
 
 
949 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0176695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2135  putative chaperone protein, HscA/DnaK  40.19 
 
 
961 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1546  DnaK-related protein  41.44 
 
 
935 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0047  heat shock protein 70  41.44 
 
 
935 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0059  DnaK-related protein  40.78 
 
 
942 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2123  putative chaperone protein, HscA/DnaK  38.07 
 
 
986 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0625  DnaK-related protein  39.1 
 
 
961 aa  381  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3698  DnaK-related protein  39.84 
 
 
956 aa  378  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.900724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0495  DnaK-related protein  39.84 
 
 
951 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0799575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5719  DnaK-related protein  40.49 
 
 
951 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.376499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0986  hypothetical protein  38.44 
 
 
948 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3740  putative chaperone heat-shock protein  40 
 
 
952 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.207113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02520  hypothetical protein  38.54 
 
 
941 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1306  DnaK-related protein  40.95 
 
 
951 aa  360  3e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1233  chaperone DnaK-related protein  37.92 
 
 
939 aa  360  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0953918 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1827  putative chaperone heat-shock protein  36.45 
 
 
938 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.276059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003559  DnaK-related protein  37.72 
 
 
936 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2055  molecular chaperone  37.85 
 
 
906 aa  319  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.421939  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2689  Heat shock protein 70  28.17 
 
 
562 aa  104  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1194  molecular chaperone DnaK  25.61 
 
 
635 aa  100  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00921212  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0440  chaperone protein DnaK  28.18 
 
 
618 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42970  molecular chaperone DnaK  25.33 
 
 
642 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1481  chaperone protein HscA  33.33 
 
 
625 aa  97.4  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0290356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1526  molecular chaperone DnaK  24.56 
 
 
647 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1712  molecular chaperone DnaK  25.44 
 
 
645 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2571  molecular chaperone DnaK  25.17 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0972  molecular chaperone DnaK  29.04 
 
 
641 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1226  molecular chaperone DnaK  24.12 
 
 
654 aa  95.5  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0562315  normal  0.0186533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1823  chaperone protein HscA  31.82 
 
 
620 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.582459  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00560  molecular chaperone DnaK  31.79 
 
 
621 aa  94.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00014  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3583  chaperone protein DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0014  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.720404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0014  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0015  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0012  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1660  chaperone protein HscA  33.21 
 
 
625 aa  94.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3642  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.297376  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4233  chaperone protein DnaK  28.95 
 
 
623 aa  94.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0017  molecular chaperone DnaK  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00014  hypothetical protein  24.89 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2468  molecular chaperone DnaK  28.83 
 
 
634 aa  93.6  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.501675  hitchhiker  0.000000000338371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0440  chaperone protein DnaK  30.25 
 
 
618 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00195865  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1856  dnaK protein  28.38 
 
 
641 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0460  chaperone protein DnaK  27.06 
 
 
643 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.299564  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1484  molecular chaperone DnaK  25.5 
 
 
640 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.840075  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0737  molecular chaperone DnaK  25 
 
 
650 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0364172  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1743  chaperone protein HscA  31.82 
 
 
620 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000392017  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1472  chaperone protein DnaK  26.77 
 
 
634 aa  92.8  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0182845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0490  chaperone protein DnaK  30.46 
 
 
623 aa  93.6  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000032469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4593  molecular chaperone DnaK  26.73 
 
 
611 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>