More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2476 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  52.9 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  52.26 
 
 
181 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  51.95 
 
 
163 aa  160  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.72 
 
 
177 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  48.72 
 
 
188 aa  153  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  53.85 
 
 
165 aa  151  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  51.61 
 
 
163 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  54.49 
 
 
165 aa  150  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  53.85 
 
 
165 aa  150  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0430  Ferritin Dps family protein  49.02 
 
 
176 aa  147  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00669774  hitchhiker  0.00115538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  54.92 
 
 
157 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  54.26 
 
 
137 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.41 
 
 
167 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.41 
 
 
167 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.41 
 
 
167 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.41 
 
 
167 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  46.41 
 
 
167 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0703  Ferritin Dps family protein  46.41 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.79 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.79 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.79 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.44 
 
 
167 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  45.1 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  44.16 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.14 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  43.51 
 
 
167 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  42.95 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  41.18 
 
 
167 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  44.94 
 
 
160 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  41.83 
 
 
179 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  39.42 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  38.56 
 
 
178 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1431  Ferritin Dps family protein  41.09 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103908  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  35.95 
 
 
158 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  36.17 
 
 
179 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  36.17 
 
 
179 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  36.17 
 
 
179 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5065  Ferritin Dps family protein  37.5 
 
 
188 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  32.37 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5700  Ferritin, Dps family protein  34.75 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.963789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0224  Ferritin Dps family protein  32.03 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  31.91 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  31.21 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1812  Ferritin and Dps  31.25 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001469  non-specific DNA-binding protein Dps/iron-binding ferritin-like antioxidant protein/ferroxidase  33.33 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2302  Ferritin Dps family protein  38.19 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112088  normal  0.237053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03560  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  34.97 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  31.91 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  31.91 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0759  Ferritin and Dps  36.11 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  32.62 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  32.62 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2447  ferritin and Dps  33.83 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.429577  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  31.21 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1112  Ferritin, Dps family protein  34.75 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  31.21 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2687  putative DNA protection during starvation or oxydative stress transcription regulator protein  34.69 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  31.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  31.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  31.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  31.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0619  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1283  Ferritin and Dps  31.54 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  31.21 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2511  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.816956  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  31.97 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  38.62 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  39.13 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0714  Ferritin Dps family protein  35.42 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1791  Ferritin Dps family protein  37.68 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.384711  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05408  hypothetical protein  32.56 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1468  Ferritin Dps family protein  32.21 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2658  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329969  normal  0.0258141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2923  Ferritin Dps family protein  36.11 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0395  Ferritin and Dps  33.33 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.680559  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0102  Ferritin Dps family protein  36.42 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3984  ferritin DPS family DNA-binding protein  34.72 
 
 
165 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3741  Ferritin and Dps  34 
 
 
204 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533042  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  32.1 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3983  Dps family protein  34.23 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.257808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1404  Ferritin and Dps  34.23 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2868  Ferritin and Dps  31.58 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2149  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000025192  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0109  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)-like  38.19 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.123517  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1284  DpsA  37.23 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0195  Ferritin and Dps  30.83 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  31.65 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0957  Ferritin and Dps  32.89 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.104703 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1120  Ferritin and Dps  34.9 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143063  normal  0.27853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>