More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0500 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0500  ribosomal protein L17  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.247966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  39.77 
 
 		 161 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  40.45 
 
 		 139 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 127 aa  101  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 124 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 124 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  38.82 
 
 		 161 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 134 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.42 
 
 		 137 aa  98.2  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  40.59 
 
 		 132 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  40.59 
 
 		 132 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 130 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 133 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 130 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 130 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 130 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  40.24 
 
 		 132 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  37.77 
 
 		 139 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 130 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 126 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 129 aa  95.9  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  37.87 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 128 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  42.01 
 
 		 130 aa  95.5  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 126 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  37.13 
 
 		 140 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 127 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  95.5  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  37.87 
 
 		 127 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  95.5  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  39.2 
 
 		 143 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  40.59 
 
 		 131 aa  95.5  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 140 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  37.87 
 
 		 140 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  40.59 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  40.24 
 
 		 131 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 137 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  42.6 
 
 		 129 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 141 aa  94.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  42.6 
 
 		 129 aa  94.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  41.76 
 
 		 131 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  42.6 
 
 		 129 aa  94.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 141 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  38.82 
 
 		 132 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  39.64 
 
 		 128 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  39.64 
 
 		 146 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  35.98 
 
 		 137 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  37.87 
 
 		 140 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 138 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  42.01 
 
 		 126 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 135 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  40.83 
 
 		 126 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  36.46 
 
 		 141 aa  92.8  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  37.5 
 
 		 138 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  41.42 
 
 		 128 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  35.42 
 
 		 151 aa  91.3  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 141 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  37.28 
 
 		 136 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  33.98 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  38.46 
 
 		 126 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 130 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 130 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  36.84 
 
 		 124 aa  89.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  39.05 
 
 		 133 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  35.75 
 
 		 139 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>