More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0486 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0486  ribosomal protein S17  100 
 
 
87 aa  176  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0403  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
84 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0378  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
84 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  53.95 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  57.33 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0217  ribosomal protein S17  50.59 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  53.16 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1409  ribosomal protein S17  49.37 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2165  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4267  ribosomal protein S17  54.79 
 
 
86 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000045276  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0435  ribosomal protein S17  52.5 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266515  hitchhiker  0.000093478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  51.28 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2650  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 
96 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  51.95 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0332  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
89 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000351608  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  47.3 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2705  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2390  30S ribosomal protein S17  53.16 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0596  ribosomal protein S17  52.56 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.729409  normal  0.989269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  53.25 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  52.56 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  48.75 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0636  ribosomal protein S17  53.16 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.757439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0414  ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0217362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  48.1 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0120  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326224  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29650  SSU ribosomal protein S17P  51.28 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.370615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  48.1 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0876  30S ribosomal protein S17  51.28 
 
 
84 aa  77  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.014165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
82 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  51.95 
 
 
94 aa  77  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0315  SSU ribosomal protein S17P  50.63 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000814875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
82 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10724  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706337  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5040  ribosomal protein S17  51.28 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0780546  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3134  ribosomal protein S17  51.28 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  46.25 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  52.11 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1049  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  48.1 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1022  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0401706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1039  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0891213  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0498  SSU ribosomal protein S17P  52.11 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348408  hitchhiker  0.00374452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  49.35 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0493  ribosomal protein S17  52.11 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  52.63 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  48.1 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1314  ribosomal protein S17  51.28 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  50.65 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3319  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000278242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  48.72 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0282  ribosomal protein S17  48.05 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000068938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0940  ribosomal protein S17  53.85 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138584  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0942  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00308602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0767  ribosomal protein S17  46.84 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000021976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2966  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1132  ribosomal protein S17  50 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>