More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0013 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0013  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 110 aa  222  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  52 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 110 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.25 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1982  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  31.82 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  34.52 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1661  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  31.87 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  29 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  34.18 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  31.25 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  28.57 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  32.5 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  32.91 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  32.47 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  31.37 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  31.08 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 368 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  34.85 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  30.67 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  26.19 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  31.65 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  27.71 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  29.27 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  35.06 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  25.61 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  29.11 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  30.12 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  30.12 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  32 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>