More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2594 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  35 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  34.5 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  31.9 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  33.05 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  35 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.09 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.17 
 
 		 442 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.26 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  31.5 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 591 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 		 442 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.84 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.78 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.78 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.7 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.81 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.97 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  26.54 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.3 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.41 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.53 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.02 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  27.62 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 215 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  24.38 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.14 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  24.45 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 449 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.66 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  24.62 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  25.26 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  25.27 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.32 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>