More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2248 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  55.61 
 
 		 221 aa  228  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  55.76 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3750  L-fuculose-phosphate aldolase  50.7 
 
 		 227 aa  214  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  54.63 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1228  putative L-fuculose phosphate aldolase  50.7 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.642951  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  45.89 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  45.89 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4174  L-fuculose-phosphate aldolase  46.83 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2398  L-fuculose-phosphate aldolase  49.76 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064801  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0476  L-fuculose-phosphate aldolase  49.76 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2128  L-fuculose-phosphate aldolase  49.76 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  46.86 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  50.5 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2684  class II aldolase/adducin family protein  47.66 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  0.449845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  48.08 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  48.08 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  48.08 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  50.97 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  50.72 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  50.97 
 
 		 216 aa  195  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  47.6 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  48.08 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0888  L-fuculose phosphate aldolase  47.6 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  44.08 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  47.83 
 
 		 209 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  46.63 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  46.63 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  46.63 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1036  class II aldolase/adducin family protein  49.22 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  46.63 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1122  class II aldolase/adducin family protein  47.22 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.404632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3633  L-fuculose-phosphate aldolase  45.37 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  43.96 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  42.25 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  50.24 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  45.67 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3293  class II aldolase/adducin family protein  49.49 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178192  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  44.6 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  42.45 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0523  L-fuculose-phosphate aldolase  44.55 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  42.86 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  40.19 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  38.79 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  40.1 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3550  class II aldolase/adducin family protein  41.35 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  45.45 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  44.5 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  44.5 
 
 		 229 aa  160  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3072  L-fuculose phosphate aldolase  55.24 
 
 		 152 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0460293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0040  class II aldolase/adducin family protein  40.58 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000104047  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  36.41 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  37.68 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0395  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0328  L-fuculose phosphate aldolase  37.5 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4923  L-fuculose phosphate aldolase  37.5 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191657  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0333  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.618561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0317  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0320  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.4164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0380  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0442  L-fuculose phosphate aldolase  37.98 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  39.51 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0444  L-fuculose phosphate aldolase  37.5 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  37.02 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  36.71 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0348  L-fuculose phosphate aldolase  37.5 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  42.73 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  38.28 
 
 		 237 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  42.02 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  37.62 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.91 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  36.1 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  36.84 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  38.46 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  36.02 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.29 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  36.5 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.04 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  34.15 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  35.02 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5404  class II aldolase/adducin family protein  36.08 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  33.01 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  36.79 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  33.18 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  38.96 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  35.78 
 
 		 207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.88 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.88 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  36.76 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.55 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  32.32 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.18 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  32.55 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  29.46 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.8 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  33.16 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  32.63 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  35.8 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.87 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>