More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1877 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1877  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 364 aa  745    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13758  dehydrogenase  46.53 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0782561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2276  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.99 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2325  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0442784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.88 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2333  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 385 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.255092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5762  alcohol dehydrogenase  46.91 
 
 		 386 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117069  normal  0.104571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.27 
 
 		 387 aa  302  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5159  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.821329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4773  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4859  alcohol dehydrogenase  45.78 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0310  alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3714  alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000625  zinc-binding dehydrogenase  38.63 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0305  alcohol dehydrogenase  38.69 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0851572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7154  alcohol dehydrogenase  39.45 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.0194652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.2 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.2 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  31.2 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.2 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.2 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  31.2 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  30.75 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.93 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.93 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  30.46 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.93 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.83 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.1 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0111  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  31.73 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.83 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  30.65 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1043  alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 		 353 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.48 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0330  2,3-butanediol dehydrogenase  30.03 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.84 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  27.57 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.58 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 373 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3248  sorbitol dehydrogenase  27.84 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0582225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 		 337 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.36 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  26.88 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.16 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.95 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.9 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.8 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3625  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.38 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00723934  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  26.08 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  29.01 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.18 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2959  alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0784  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.6 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0125  alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0844378  normal  0.76692 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.42 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.06 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.19 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.76 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  27.59 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4034  alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.03 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  28.65 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.155342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0788  alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.47 
 
 		 378 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.49 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.02 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0527  alcohol dehydrogenase  24.93 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2032  sorbitol dehydrogenase, putative  29.27 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000906358  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74116  Sorbitol dehydrogenase  28.07 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  26.84 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>