More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1366 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
395 aa  816    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66758  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.08 
 
 
386 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.960119  normal  0.0627799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.22 
 
 
387 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982054  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.03 
 
 
380 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  35.51 
 
 
381 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  35.51 
 
 
381 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  35.51 
 
 
381 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.25 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.02 
 
 
386 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.25 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  35.25 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.08 
 
 
377 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.46 
 
 
380 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.82 
 
 
394 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.4 
 
 
383 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2430  acyl-CoA dehydrogenase-like  38.87 
 
 
385 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000440313  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.57 
 
 
399 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.14 
 
 
383 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  36.8 
 
 
381 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  37.06 
 
 
381 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.34 
 
 
376 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.92 
 
 
389 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  36.55 
 
 
381 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.05 
 
 
379 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  36.76 
 
 
376 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0858  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.01 
 
 
386 aa  225  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1835  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  33.78 
 
 
394 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 
376 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 
376 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 
376 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 
376 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.65 
 
 
379 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.72 
 
 
385 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  36.5 
 
 
376 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.46 
 
 
382 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.53 
 
 
379 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 
386 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0837  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.94 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7492  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.6 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960511  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  37.17 
 
 
385 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.5 
 
 
376 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4180  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.17 
 
 
383 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4635  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 
386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4054  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.11 
 
 
384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.96 
 
 
380 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4085  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.82 
 
 
387 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14575  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0441  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
401 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.25 
 
 
384 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0615  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.55 
 
 
387 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.210833  normal  0.0397055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1604  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
387 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4073  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.31 
 
 
386 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.2 
 
 
383 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.51 
 
 
380 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4224  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.75 
 
 
400 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0700017  normal  0.0824066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.03 
 
 
386 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5538  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
384 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.94 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  36.1 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  34.82 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  34.37 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4610  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.63 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000229425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.47 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0202  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.51 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0171  butyryl-CoA dehydrogenase  36.41 
 
 
385 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.260341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1523  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.91 
 
 
397 aa  213  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0413288  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4169  butyryl-CoA dehydrogenase  34.03 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4181  butyryl-CoA dehydrogenase  34.03 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0181503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.07 
 
 
376 aa  212  9e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  33.94 
 
 
379 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  35.79 
 
 
376 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  34.46 
 
 
379 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5985  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.84 
 
 
376 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  35.32 
 
 
386 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  33.94 
 
 
379 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.94 
 
 
379 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.86 
 
 
380 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0673  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.55 
 
 
400 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  34.2 
 
 
379 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.86 
 
 
386 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0244674  normal  0.176746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.73 
 
 
383 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.28 
 
 
417 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37799  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1261  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.46 
 
 
385 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1132  Acyl-CoA dehydrogenase, type 1  34.46 
 
 
385 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0182  butyryl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
385 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0191  butyryl-CoA dehydrogenase  35.88 
 
 
385 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297032  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.77 
 
 
382 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2167  butyryl-CoA dehydrogenase  37.57 
 
 
399 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.710802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0730  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.47 
 
 
381 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  34.2 
 
 
379 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.46 
 
 
385 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0644386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>