More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1149 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1149  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
627 aa  1267    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1165  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.39 
 
 
645 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11410  acetophenone carboxylase  45.78 
 
 
645 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.488439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1451  hydantoinase/oxoprolinase family protein  44.29 
 
 
639 aa  526  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.589264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1204  hydantoinase/oxoprolinase  47.26 
 
 
665 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114789  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.89 
 
 
643 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1338  hydantoinase/oxoprolinase  45.81 
 
 
643 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4896  hydantoinase/oxoprolinase  44.2 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833131  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2509  hydantoinase/oxoprolinase  42.83 
 
 
637 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212275  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2237  hydantoinase/oxoprolinase  42.97 
 
 
638 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570918  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1831  hydantoinase/oxoprolinase  42.75 
 
 
638 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1850  hydantoinase/oxoprolinase  32.15 
 
 
647 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2239  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.45 
 
 
708 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0220335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1848  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.7 
 
 
726 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0551032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1833  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.33 
 
 
731 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2507  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33 
 
 
708 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11390  acetophenone carboxylase  28.35 
 
 
711 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1151  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.44 
 
 
710 aa  233  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1449  acetone carboxylase beta subunit  30.12 
 
 
712 aa  232  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1163  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
711 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1206  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.79 
 
 
725 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4360  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
708 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4898  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.79 
 
 
709 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466599  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.16 
 
 
706 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.16 
 
 
765 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.38 
 
 
674 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.91 
 
 
658 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.87 
 
 
690 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  33.66 
 
 
686 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.7 
 
 
676 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
682 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.9 
 
 
679 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.14 
 
 
676 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.62 
 
 
692 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.88 
 
 
680 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.27 
 
 
690 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.65 
 
 
698 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.96 
 
 
702 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.38 
 
 
684 aa  190  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.53 
 
 
691 aa  190  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.58 
 
 
672 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
680 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.49 
 
 
692 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.49 
 
 
687 aa  187  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.63 
 
 
694 aa  186  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  27.35 
 
 
672 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.13 
 
 
694 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.36 
 
 
707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.26 
 
 
691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  28.86 
 
 
680 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.92 
 
 
711 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.86 
 
 
721 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  30.82 
 
 
676 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.34 
 
 
663 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20910  Acetone carboxylase beta subunit; AcxA  28.88 
 
 
717 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.81 
 
 
765 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.67 
 
 
691 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.68 
 
 
683 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  27.6 
 
 
694 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  29.98 
 
 
682 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.98 
 
 
660 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  31.01 
 
 
685 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.54 
 
 
678 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.82 
 
 
704 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  30.52 
 
 
678 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.82 
 
 
680 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  26.82 
 
 
687 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  27.99 
 
 
692 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6150  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.86 
 
 
714 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.353308 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  26.73 
 
 
681 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.94 
 
 
692 aa  174  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.08 
 
 
681 aa  173  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.15 
 
 
694 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.92 
 
 
651 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.5 
 
 
697 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.41 
 
 
707 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.02 
 
 
692 aa  171  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
712 aa  171  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.18 
 
 
684 aa  171  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6172  acetone carboxylase, beta subunit  27.58 
 
 
714 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.47 
 
 
694 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.15 
 
 
694 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.08 
 
 
688 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.72 
 
 
684 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.49 
 
 
706 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.55 
 
 
682 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2246  hydantoinase/oxoprolinase  26.45 
 
 
698 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0794287  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.16 
 
 
681 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0943  hydantoinase/oxoprolinase  28.09 
 
 
715 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.4 
 
 
690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.89 
 
 
712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.01 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.55 
 
 
687 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.76 
 
 
690 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.32 
 
 
652 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.3 
 
 
1229 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.83 
 
 
684 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.53 
 
 
683 aa  164  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1018  acetone carboxylase, beta subunit  28.12 
 
 
715 aa  163  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.38 
 
 
706 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>