38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0243 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  52.17 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  55.36 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  54.46 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 114 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  53.7 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  54.46 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 172 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 155 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.11 
 
 		 146 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>