More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1238 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1238  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 		 331 aa  674    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0185  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  83.38 
 
 		 335 aa  580  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.374978  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0202  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  74.91 
 
 		 291 aa  461  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.630911 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0675  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  65.65 
 
 		 333 aa  457  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1761  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.24 
 
 		 392 aa  192  9e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1605  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.32 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.119603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1333  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.68 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.206464  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.97 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.553132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1593  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.77 
 
 		 291 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.516871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  28.77 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  27.14 
 
 		 290 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  29.86 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  29.62 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  26.91 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0720  cysteine synthase  30.51 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  27.48 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0315  cysteine synthase  31.82 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.70232  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0768  cysteine synthase B  29.01 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  27.78 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  27.78 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  28.19 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  29.66 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  28.12 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  29.51 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  28.63 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  29.29 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  31.54 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  28.82 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  29.1 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  30.22 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  30.22 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  26.16 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  30.22 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  29.1 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  31.03 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  28.04 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  27.72 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  28.04 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  27.94 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  28.04 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  28.04 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  28.04 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  28.04 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0094  cysteine synthase/cystathionine beta-synthase family protein  27.46 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0481  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.11 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000231361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  29.9 
 
 		 773 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0494  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.11 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0952  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.86 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  29.39 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  27.94 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.43 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  29.1 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  28.74 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  28.73 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  28.74 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  28.31 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  28.94 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1677  cysteine synthase  29.63 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  28.81 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  31.8 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  27.88 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  26.76 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  30.04 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  29.7 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  27.48 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  28.18 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  26.8 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  30.42 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1609  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.5 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  29.01 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  27.69 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  28.57 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  26.44 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  29.05 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.93 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  27.03 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  26.46 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1111  cysteine synthase A  30.04 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0492008  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  27.03 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  27.03 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  28.07 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  28.57 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  29.47 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  28.07 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  27.57 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  28.03 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  28.46 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  26.64 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  29.51 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  30.33 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  28.03 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  25.87 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  28.18 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  27.97 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  26.82 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  28.1 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  25.91 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0670  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  27.34 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  28.25 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  27.34 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>