37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2814 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  344  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  33.76 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  34.9 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  34.87 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  37.84 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  31.65 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  31.75 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  33.94 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  34.75 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  34.31 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  34.75 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  27.83 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  30.17 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  33.62 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  33.76 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  31.3 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  31.43 
 
 
162 aa  57.8  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  30.99 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  33.96 
 
 
197 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  35.92 
 
 
182 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  27.92 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  34.82 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  33.02 
 
 
183 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  28.1 
 
 
164 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  33.96 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  33.96 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  27.4 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3115  hypothetical protein  32.56 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0723929  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  33.02 
 
 
197 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  25 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1719  hypothetical protein  25.77 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820837  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  24.07 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3712  hypothetical protein  30.25 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>