251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2769 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2769  ABC transporter permease protein  100 
 
 		 580 aa  1147    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.405226  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02679  hypothetical protein  52.01 
 
 		 569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003794  ABC transporter permease protein YnjC  50.7 
 
 		 569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00213476  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2503  putative transport system, permease protein  50.87 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1270  putative ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 566 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.205308  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2439  ABC transporter, fused inner membrane subunits  35.65 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0749962  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000173691 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1445  ABC-type spermidine/putrescine transport system permease component II-like protein  36.97 
 
 		 562 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 		 608 aa  286  9e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.639645  normal  0.0781406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 		 570 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2252  ABC transporter, fused inner membrane subunits  36.03 
 
 		 565 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1833  ABC transporter, fused inner membrane subunits  38.11 
 
 		 562 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0201  ABC transporter, fused inner membrane subunits  38 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3277  putative permease ABC transporter protein  35.01 
 
 		 565 aa  260  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4045  putative permease ABC transporter protein  33.52 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01790  putative ABC-type transport system, permease component  29.54 
 
 		 581 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0392  ABC transporter, permease protein, putative  34.38 
 
 		 549 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1978  ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.647759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2004  ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.272966  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.57 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1887  ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1877  putative transport system permease protein  31.23 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1435  ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.026672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1839  ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01724  fused transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  41.41 
 
 		 496 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01712  hypothetical protein  41.41 
 
 		 496 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2474  ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 511 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 		 293 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.449402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.48 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0308  ABC transporter, permease protein, putative  27.23 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.99 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  26.48 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.500161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.92 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.519563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 		 665 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.716574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.38 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.99 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0303  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  24.91 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0329  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  26.24 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 		 262 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  27.62 
 
 		 270 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  24.16 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0182  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.46 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  21.24 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.03 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.93964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  26.03 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  26.03 
 
 		 256 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.86 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 		 282 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.24 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.24 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 		 272 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.24 
 
 		 281 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  24.12 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 		 272 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  23.79 
 
 		 273 aa  55.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.28 
 
 		 515 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 		 287 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  27.56 
 
 		 262 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  25.36 
 
 		 260 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 		 588 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.7 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.710865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2825  NifC-like ABC-type porter  28.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  27.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.41 
 
 		 510 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2798  NifC-like ABC-type porter  28.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1648  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.61 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.256197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2842  NifC-like ABC-type porter  28.87 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11886  molbdenum-transport integral membrane protein ABC transporter modB  31.25 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 		 265 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  23.6 
 
 		 271 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  27.93 
 
 		 289 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.67 
 
 		 282 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.09 
 
 		 264 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.46 
 
 		 277 aa  51.6  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.88 
 
 		 261 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  25.16 
 
 		 256 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.23 
 
 		 264 aa  51.2  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.51 
 
 		 261 aa  51.2  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.85 
 
 		 262 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 		 263 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 270 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  22.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 		 587 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  23.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  23.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  23.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  23.97 
 
 		 271 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>