188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1814 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3161  Ion transport 2 domain protein  47.45 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  47.29 
 
 
256 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1249  Ion transport 2 domain protein  50.81 
 
 
249 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1106  Ion transport 2 domain-containing protein  49.6 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2762  Ion transport 2  52.05 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2765  Ion transport 2  47.83 
 
 
258 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2720  Ion transport protein  49.21 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  47.83 
 
 
256 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  47.83 
 
 
256 aa  225  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2729  putative ion transport protein  43.7 
 
 
288 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236558  normal  0.0248863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  41.3 
 
 
271 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1178  Ion transport 2  38.35 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  39.7 
 
 
265 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1838  Ion transport 2 domain protein  41.57 
 
 
264 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  32.54 
 
 
276 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  35.85 
 
 
263 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  30.59 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  30.33 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  30.88 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  30.88 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  30.88 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  28 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1582  Ion transport 2 domain-containing protein  28.01 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  31.08 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  28.63 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.62 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  28.16 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  31.08 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  30.52 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  28.42 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  28.02 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  27.36 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  28.36 
 
 
276 aa  82  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  26.32 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  30.62 
 
 
282 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  32.58 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  26.89 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  27.76 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  30.97 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  30.4 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  34.15 
 
 
228 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  29.44 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  27.44 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.66 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  27.02 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  28.68 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.77 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  28.17 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  27.46 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  27.46 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  29.26 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  29.87 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  27.66 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  27.46 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  30.04 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  28.47 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  26.03 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  29.69 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  29.2 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  27.23 
 
 
282 aa  72  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  28.64 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  31.41 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1499  Ion transport 2 domain-containing protein  30.11 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  33.18 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  26.64 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  27.78 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  27.4 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  28.72 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  26.34 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  26.34 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  27.54 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  26.34 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  27.54 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  26.34 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  26.34 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  28.05 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  27.91 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  31.03 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  28.05 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0262  Ion transport 2 domain-containing protein  29.11 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  27.57 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  30.32 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  25 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  26.23 
 
 
308 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  25.68 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  31.72 
 
 
325 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  25.95 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  26.57 
 
 
531 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  31.03 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  27.83 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  25 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  27.48 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  29.48 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2927  Ion transport protein  27.16 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  25.2 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  29.11 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>