51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1409 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
287 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  31.25 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  23.68 
 
 
303 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  25.44 
 
 
322 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  25.33 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  24.29 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  25.26 
 
 
595 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  23.65 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  29.75 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  25.76 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  45 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  23.71 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3364  aminoglycoside phosphotransferase  28.08 
 
 
262 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  22.05 
 
 
276 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  24.4 
 
 
338 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13550  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 
312 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.669259  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.6 
 
 
522 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.65 
 
 
611 aa  46.2  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  24.26 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  22.69 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  24.47 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  21.76 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  20.55 
 
 
589 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  36.99 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  33.33 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  41.67 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  38.46 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  30.61 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  30.61 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0179  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0281  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
443 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  24.79 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  24.79 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  24.79 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1869  aminoglycoside phosphotransferase  26.36 
 
 
378 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0573919  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4000  aminoglycoside phosphotransferase  44 
 
 
347 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  24 
 
 
244 aa  43.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  24.39 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  32.58 
 
 
379 aa  42.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  25.57 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  39.58 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>