49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2192 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2192  spore coat protein CotS  100 
 
 
333 aa  677    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00336173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2482  spore coat protein CotS  99.1 
 
 
334 aa  672    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.915972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0543  spore coat protein, CotS family  43.96 
 
 
330 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2398  putative spore coat protein  39.56 
 
 
329 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0017  spore coat protein, CotS family  32.22 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2196  spore coat protein, putative  29.75 
 
 
335 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0443073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2486  putative spore coat protein  28.93 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000540962  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1978  hypothetical protein  28.44 
 
 
359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2267  putative spore coat protein  27.79 
 
 
359 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2484  putative spore coat protein  30.62 
 
 
342 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3824  CotS family spore coat protein  24.34 
 
 
347 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2194  spore coat protein, putative  30.46 
 
 
342 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00168617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1084  spore coat protein  29.67 
 
 
345 aa  135  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2083  spore coat protein CotS  28.74 
 
 
350 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.694942  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5431  spore coat protein CotS  27.4 
 
 
372 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.472752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1083  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  25.45 
 
 
349 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1090  spore coat protein, CotS family  28.95 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.26177  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5429  spore coat protein CotS  25.53 
 
 
352 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.917959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1130  spore coat protein, CotS family  26.52 
 
 
333 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2081  spore coat protein CotS  24.32 
 
 
355 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1639  spore coat protein, CotS family  23.17 
 
 
364 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0449  aminoglycoside phosphotransferase  22.84 
 
 
351 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0541  spore coat protein, CotS family  24.53 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1091  spore coat protein, CotS family  22.48 
 
 
331 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0542  hypothetical protein  24.46 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2898  spore coat protein YutH  23.79 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0693926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5094  spore coat protein cotS  23.53 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  21.67 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0802  aminoglycoside phosphotransferase  20.93 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4823  spore coat protein cotS  22.49 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5088  spore coat protein cotS  23.53 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5188  spore coat protein cotS  22.49 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.518825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4680  spore coat protein  23.53 
 
 
333 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5096  spore coat protein cotS  23.04 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0146  spore coat protein cotS  23.04 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3555  spore coat protein YutH  23.33 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4661  spore coat protein  22.49 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5058  spore coat protein cotS  22.01 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0151  aminoglycoside phosphotransferase  24.07 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
287 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  33.96 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3043  spore coat protein YutH  19.47 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2120  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  35.48 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2434  aminoglycoside phosphotransferase  22.34 
 
 
396 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0682  aminoglycoside phosphotransferase  22.54 
 
 
260 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4773  spore coat protein YutH  21.37 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  20.66 
 
 
327 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>